Les deux chapelles du transept, le déambulatoire, les baies hautes du chœur et la grande rose du chevet ont été réalisés par Jean Le Moal et le maître-verrier Bernard Allain et l’ensemble posé en 1972.
Ce fut alors en France, le plus vaste ensemble de vitraux contemporains qui aient été posés dans un édifice ancien. C’est donc un ensemble remarquable, fruit de longues études préalables et de poses d’essai.
L’artiste Jean Le Moal s’étant aperçu que dans certaines parties de l’édifice, enclavé dans des rues hautes et étroites, la lumière n’y pénétrait qu’une fois réfléchie sur les façades des immeubles voisins dut adapter l‘épaisseur des verres et la coloration choisie.
Peut-être plus que la flèche elle-même qui signale l’Intra-Muros reconstruit à l’extérieur, cet ensemble est la manifestation la plus éclatante et la mieux réussie de l’introduction de la modernité dans le patrimoine ancien sans rien renier du caractère sacré du lieu.